三级和四级主任科员都属于综合管理类公务员职级序列，并且都对应副科级职务。以下是它们之间的主要区别：
职务对应关系
四级主任科员：属于副科级职务，但在县级部门其身份仍然是科员。
三级主任科员：也属于副科级职务，但通常是由实职副科晋升而来，因此被视为“大副科”。
工资待遇
三级主任科员：在基础性工资方面比四级主任科员高出100多元，扣除五险两金后实际增加几十元。
四级主任科员：工资待遇较三级主任科员稍低，差距通常在100元左右，具体金额因地区和单位不同而有所差异。
其他福利
三级和四级主任科员在车补、餐补、通讯补贴等福利性补贴，以及级别工资和年终考核绩效方面是相同的。
晋升前景
三级主任科员：晋升二级主任科员的主要途径，符合条件的三级主任科员可以直接晋升为二级主任科员。
四级主任科员：虽然也可以晋升为三级主任科员，但无法直接晋升为二级主任科员，需要先晋升为三级主任科员，再满足一定年限才能晋升。
政治待遇和工作待遇
三级和四级主任科员在政治待遇和工作待遇上基本相同，与科员级没有区别。
综上所述，三级主任科员在职务对应关系、工资待遇、晋升前景等方面都优于四级主任科员，而四级主任科员在政治待遇和工作待遇上与科员级相同。因此，对于希望在公务员岗位上稳步发展的人来说，选择三级主任科员职位会更有优势。