南京初中学校排名如下：
南京外国语学校（南外）
南京玄武外国语学校（玄外）
南京师范大学附属中学树人学校（树人）
南京秦淮外国语学校（秦外）
南京市育英第二外国语学校（育英二外）
南京郑和外国语学校（郑外）
南京市金陵汇文学校（汇文）
南京市第二十九中学（29中）
南京市钟英中学（钟英）
南京师范大学附属中学新城中学（新城中学）
南京市科利华中学（科利华中学）
南京求真中学（求真中学）
南京市鼓楼实验中学（鼓楼实验中学）
南京市第五十中学（50中）
南京市宁海中学分校（宁海中学分校）
南京市竹山中学（竹山中学）
南京市中华中学初中部（中华中学初中部）
南京市金陵中学河西分校（金陵中学河西分校）
南京新城中学（新城中学）
南京市河西外国语学校（河西外国语学校）
一中实验学校（一中实验学校）
雨花台中学（雨花台中学）
南京东山外国语学校（东山外校）
南京南师附中江宁分校（南师附中江宁分校）
南京市第十三中学锁金分校（第十三中学锁金分校）
南京市第九初级中学（第九初级中学）
南京市红山初级中学（红山初级中学）
南京市浦口外国语学校（浦口外国语学校）
南京民办实验学校（一中分校）（民办实验学校）
南京外国语学校河西分校（南外河西初级中学）
建议家长和学生根据孩子的实际情况和需求，选择适合的学校。排名并不是衡量学校好坏的唯一标准，学校的教学质量、师资力量、学生发展和个性化教育等方面都是重要的考量因素。