软件出口退税的申请流程如下：
确认产品是否符合退税条件
软件企业自行开发并出口的软件，属于生产企业出口自产产品的情形，可以按照免抵退税办法申报出口退税。
需要注意的是，当前我国软件产品的退税率均为0，因此实际上不能享受出口退税。根据《关于调整出口货物退税率的补充通知》，计算机软件出口（海关出口商品码9803）实行免税，其进项税额不予抵扣或退税。因此，在实践中，软件产品的出口通常按免税申报，即不计提销项，对应的进项税转出。
准备相关证明材料
对于嵌入式软件产品，企业需要准备省级软件产业主管部门认可的软件检测机构出具的检测证明材料，以及软件产业主管部门颁发的《软件产品登记证书》或著作权行政管理部门颁发的《计算机软件著作权登记证书》。
此外，还需提供出口合同、出口发票、报关单等相关单证。
计算退税额
企业根据当期嵌入式软件产品销售额、销项税额、可抵扣进项税额等信息，按照政策规定的公式计算即征即退税额。
提交退税申请
将计算好的退税额及相关证明材料提交至主管税务机关进行退税申请。退税申请应在出口货物报关出口之日起90日内办理完毕。
审核与审批
主管税务机关收到退税申请后，将对申请材料进行审核。若材料齐全、符合退税条件，税务机关将及时办理退税手续，并将退税款支付给公司。若材料不符合要求或存在疑问，税务机关将通知公司补充材料或进行进一步核实。
后续事项
在首次享受减免税时提交相关资料，后续在政策有效期内可继续享受。
在销售软件产品时，必须签订详细的销售合同，并在合同中注明软件产品的名称与软件著作权证书上的名称一致，以确保顺利备案和退税。
总结来说，虽然软件产品目前不能享受出口退税，但企业仍可通过免税申报的方式处理出口业务，并需要按照上述流程准备和提交相关证明材料。