防止软件被修改可以通过以下方法实现：
代码混淆
通过修改程序的结构和逻辑，使其难以理解。这包括重命名变量和函数、使用不直观的控制流结构等。代码混淆可以使攻击者难以理解和修改程序，从而提高程序的安全性。
加密
对程序的源代码或二进制文件进行加密，防止未经授权的访问和修改。加密可以在程序运行时动态进行，也可以在编译时静态进行。动态加密需要在程序运行时解密代码，而静态加密则将加密后的代码直接嵌入到程序中。
数字签名
使用公钥加密算法（如RSA）对程序进行签名，以确保程序在传输过程中没有被篡改。接收方可以使用相应的私钥对签名进行验证，以确认程序的来源和完整性。
时间戳
在每次修改程序时添加一个时间戳，记录程序的版本信息。这可以帮助开发者追踪程序的修改历史，并在出现问题时迅速定位问题所在。
版本控制
使用版本控制系统（如Git）管理程序修改历史，允许开发者跟踪程序的修改历史，比较不同版本的代码差异，并在出现问题时回滚到之前的版本。这有助于开发者更好地管理代码，提高开发效率，同时也可以防止未经授权的修改。
权限控制
对程序的访问和修改权限进行严格控制，防止未经授权的访问和修改。这可以通过设置用户权限、限制外部访问等方式实现。权限控制是保护程序安全的基本手段，需要与其他安全措施结合使用。
重新考虑安全性问题
在开发过程中全面考虑安全性问题，而不是将其作为单独的步骤。使用经过验证的安全框架和加密算法，避免自己重新开发安全方案。
保护静态数据
对静态数据进行加密处理，确保敏感数据的安全性。例如，使用非对称加密算法，确保解密私钥永远不会在设备上呈现。
加强程序强度
通过各种防破手段，如调试限制、代码混淆、数据加密等，提高程序的强度，使破解变得极其困难。
程序运行时自我校验
在程序运行时进行自我校验，确保程序的完整性和未被修改。例如，使用CRC算法生成校验码，并在程序运行时进行比较。
通过综合运用上述方法，可以有效地防止软件被修改，提高软件的安全性。