软件企业节税的方法主要包括以下几点：
合理利用地方税收优惠政策
在税收优惠园区设立新公司分流业务，享受地方财政的税收奖励扶持。例如，增值税和企业所得税均可奖励给企业留存部分的70-90%。
在园区设立个体户或个独企业，合理分包部分业务，享受核定征收，核定个税为0.5-1%，综合税率低至2.5%。
企业与个人发生业务，可在园区税局申请代开发票，综合税率不超过3%。
优化内部成本结构
尽量减少无效成本的支出，提高效益，从而降低税负。
充分利用国家税收优惠政策
软件企业可以申请高新技术企业或重点软件企业资格，减按15%的税率缴企业所得税。
使用研发费用加计扣除政策，享受175%的扣除。
对于经认定的技术先进型服务企业，减按15%的税率征收企业所得税。
合理利用税收洼地
在税收洼地注册个人独资企业，享受核定征收个人所得税，综合税率可控制在3%以内。
在税收洼地成立有限公司，享受地方财政的高额扶持，增值税和企业所得税奖励返还地方财政留存部分的70%-90%。
企业架构与业务模式优化
设立子公司或分公司，将部分业务分包过去，享受相应税收优惠。
通过定价转移法，将部分利润留在园区内的新公司或个体户，降低整体税负。
加强内部管理和成本控制
确保成本发票足额取得，合理列支成本，避免无票支出过多的问题。
加大研发投入，提升企业技术竞争力，同时享受研发费用加计扣除。
通过以上方法，软件企业可以有效节税，降低税负，提高企业经济效益。建议企业根据自身实际情况，选择合适的节税策略，并注意遵守相关税收法规，确保合法合规。