以软件入股时，保护产权的关键步骤如下：
明确作品归属和保护软件源代码
对企业开发的软件进行著作权登记，防止盗版和抄袭，确保软件源代码的安全。
著作权登记证书可以作为司法机关直接使用的有力证据，便于维权。
提升企业品牌声誉和增加无形资产
计算机软件可以作为高新技术出资入股，作价比例可以超过公司法规定的20%限制，达到35%甚至100%。
登记软件著作权可以提升企业品牌价值，增加企业无形资产，便于增资、融资、抵押和技术入股等。
软件著作权入股的基本流程
各股东同意软件著作权入股的股东会决议。
修改或补充公司章程，明确软件著作权的归属和使用规定。
投入增资资金，并聘请专业评估公司对软件著作权进行评估，出具资产评估报告。
建立企业的知识产权管理制度
设立专门的知识产权部门，参与软件立项、开发、销售及售后服务的每一环节，并提供法律保障。
由一名主要负责人专门负责企业知识产权事务，减少管理缺陷。
通过以上步骤，可以有效保护软件入股过程中的产权问题，确保企业的合法权益不受侵犯，并提升企业的品牌价值和市场竞争力。