阿米巴软件的做账方式主要强调“自主核算”、“独立核算”、“人人算”、“岗位算”、“及时算”、“收支算”和“倒着算”等原则。具体操作步骤如下：
自主核算
各个利润巴、服务巴、公共服务平台都要进行算账，主要关注开源节流和效率。
独立核算
在业务能形成闭环的前提下，核算本自主经营体的收入、支出、利润、效率等项下的“小账”、“细账”和“明白账”。
人人算
每个员工都要算精细的开源节流账，明确自己的岗位产出和投入。
岗位算
每个岗位要根据其特点和岗位要求，计算岗位产出和投入的账目。
及时算
根据业务需要或阿米巴报表设计的时间要求，提前算好账，尤其是阿米巴经营核算报表。
收支算
阿米巴经营的核算方式主要以收支方式算账，即算出收入是多少、成本和费用支出是多少。
倒着算
采用售价还原成本法的算法，当市场销售价锁死时，必须通过“活化成本”、持续提升效率和改善等方法降低成本，确保预期利润或更高利润指标的达成。
此外，阿米巴的核算体系还包括以下步骤：
划分系统
阿米巴组织能够独立完成一个业务，不能只是做了一个业务的一个环节。
能够独立核算，能够算出收入、费用和成本，可能是模拟的。
能够跟公司的战略目标一致。
核算系统
单位时间附加值 = （经营单元的收入 - 费用 - 成本） / 工作总时间。
反馈系统
反馈前一天的整个经营数据，反馈时间根据企业不同特点可能是1天、3天，但不应超过7天。
反馈系统对阿米巴非常重要，是一个反思评估和持续改进的系统，反映企业的管理能力。
在阿米巴软件操作中，会计科目需要重新组合，一般只分成日常费用和分摊费用两大类。
这些步骤和原则共同构成了阿米巴软件的做账方式，旨在通过精细化的核算和管理，实现企业的高效运营和利润最大化。