留置后的程序主要包括 调查与处置和 移送检察机关两个方面。
调查与处置
监察机关会继续进行调查工作，对留置对象的涉嫌违法犯罪行为全面深入审查，收集、固定证据等。
根据调查结果作出处置决定。如果被调查人确实存在违法犯罪行为，可能会依据法律作出政务处分决定；涉嫌职务犯罪的，移送检察机关依法审查、提起公诉。
移送检察机关
监察机关认为被留置人员的犯罪事实已经查清，证据确实、充分的，制作起诉意见书，连同案卷材料、证据一并移送人民检察院依法审查起诉。
检察机关会对监察机关移送的案件进行审查，判断证据是否确实充分、是否符合起诉条件等。如果符合条件则向法院提起公诉；如果不符合，可能退回监察机关补充调查或者作出不起诉决定。
此外，根据《监察法》的规定，留置期限最长不超过3个月。如果3个月的时间到了，发现被留置人存在一定的违法犯罪问题，但是还需要一定的时间去进一步查清事实、固定证据，那么就要履行延长留置的程序。
在整个过程中，被留置人员享有相应的诉讼权利，如辩护权等，以保障其合法权益。